Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim59Q922Y2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim59Q922Y2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim59Q922Y2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms