Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Clip1Q922J3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Clip1Q922J3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Clip1Q922J3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Clip1Q922J3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Clip1Q922J3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Clip1Q922J3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Clip1Q922J3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Clip1Q922J3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Clip1Q922J3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Clip1Q922J3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Clip1Q922J3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Clip1Q922J3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Clip1Q922J3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Clip1Q922J3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Clip1Q922J3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Clip1Q922J3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Clip1Q922J3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Clip1Q922J3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Clip1Q922J3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Clip1Q922J3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Clip1Q922J3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Clip1Q922J3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Clip1Q922J3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Clip1Q922J3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Clip1Q922J3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Clip1Q922J3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Clip1Q922J3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Clip1Q922J3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Clip1Q922J3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Clip1Q922J3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Clip1Q922J3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Clip1Q922J3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Clip1Q922J3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Clip1Q922J3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Clip1Q922J3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Clip1Q922J3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Clip1Q922J3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Clip1Q922J3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Clip1Q922J3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Clip1Q922J3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Clip1Q922J3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Clip1Q922J3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Clip1Q922J3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Clip1Q922J3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Clip1Q922J3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Clip1Q922J3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Clip1Q922J3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Clip1Q922J3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Clip1Q922J3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Clip1Q922J3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Clip1Q922J3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Clip1Q922J3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Clip1Q922J3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Clip1Q922J3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Clip1Q922J3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms