Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sf3b3Q921M3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sf3b3Q921M3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms