Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Afg3l1Q920A7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Afg3l1Q920A7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Afg3l1Q920A7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms