Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca5Q91ZW3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca5Q91ZW3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smarca5Q91ZW3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms