Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z38

Ttc1, Tetratricopeptide repeat protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc1Q91Z38 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc1Q91Z38 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ttc1Q91Z38 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc1Q91Z38 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc1Q91Z38 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc1Q91Z38 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc1Q91Z38 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc1Q91Z38 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc1Q91Z38 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc1Q91Z38 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc1Q91Z38 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc1Q91Z38 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc1Q91Z38 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc1Q91Z38 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc1Q91Z38 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc1Q91Z38 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc1Q91Z38 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc1Q91Z38 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms