Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb12Q91Y07 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pcdhb12Q91Y07 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb12Q91Y07 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms