Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Basp1Q91XV3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Basp1Q91XV3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms