Protein–RNA interactions for Protein: Q91XS1

Mtmr4, Myotubularin-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr4Q91XS1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Mtmr4Q91XS1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mtmr4Q91XS1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mtmr4Q91XS1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mtmr4Q91XS1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mtmr4Q91XS1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mtmr4Q91XS1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mtmr4Q91XS1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mtmr4Q91XS1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mtmr4Q91XS1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mtmr4Q91XS1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mtmr4Q91XS1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mtmr4Q91XS1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mtmr4Q91XS1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mtmr4Q91XS1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mtmr4Q91XS1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mtmr4Q91XS1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Mtmr4Q91XS1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mtmr4Q91XS1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Mtmr4Q91XS1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mtmr4Q91XS1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mtmr4Q91XS1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mtmr4Q91XS1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms