Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Creb3l3Q91XE9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Creb3l3Q91XE9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Creb3l3Q91XE9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Creb3l3Q91XE9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Creb3l3Q91XE9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Creb3l3Q91XE9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Creb3l3Q91XE9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Creb3l3Q91XE9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Creb3l3Q91XE9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Creb3l3Q91XE9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Creb3l3Q91XE9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Creb3l3Q91XE9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Creb3l3Q91XE9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Creb3l3Q91XE9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Creb3l3Q91XE9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Creb3l3Q91XE9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Creb3l3Q91XE9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Creb3l3Q91XE9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Creb3l3Q91XE9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Creb3l3Q91XE9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Creb3l3Q91XE9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Creb3l3Q91XE9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Creb3l3Q91XE9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Creb3l3Q91XE9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Creb3l3Q91XE9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Creb3l3Q91XE9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Creb3l3Q91XE9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Creb3l3Q91XE9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Creb3l3Q91XE9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Creb3l3Q91XE9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Creb3l3Q91XE9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Creb3l3Q91XE9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Creb3l3Q91XE9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Creb3l3Q91XE9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms