Protein–RNA interactions for Protein: Q91WU4

Tmco4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco4Q91WU4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmco4Q91WU4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms