Protein–RNA interactions for Protein: Q91VJ5

Pqbp1, Polyglutamine-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pqbp1Q91VJ5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pqbp1Q91VJ5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pqbp1Q91VJ5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pqbp1Q91VJ5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pqbp1Q91VJ5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pqbp1Q91VJ5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pqbp1Q91VJ5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pqbp1Q91VJ5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pqbp1Q91VJ5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pqbp1Q91VJ5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pqbp1Q91VJ5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pqbp1Q91VJ5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pqbp1Q91VJ5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pqbp1Q91VJ5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pqbp1Q91VJ5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pqbp1Q91VJ5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pqbp1Q91VJ5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pqbp1Q91VJ5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pqbp1Q91VJ5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms