Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hps3Q91VB4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hps3Q91VB4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hps3Q91VB4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.8 ms