Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmcd1Q8VEE1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmcd1Q8VEE1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmcd1Q8VEE1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmcd1Q8VEE1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmcd1Q8VEE1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmcd1Q8VEE1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmcd1Q8VEE1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmcd1Q8VEE1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmcd1Q8VEE1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmcd1Q8VEE1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmcd1Q8VEE1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmcd1Q8VEE1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmcd1Q8VEE1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmcd1Q8VEE1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms