Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Fyco1Q8VDC1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fyco1Q8VDC1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fyco1Q8VDC1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fyco1Q8VDC1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fyco1Q8VDC1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Fyco1Q8VDC1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Fyco1Q8VDC1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Fyco1Q8VDC1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Fyco1Q8VDC1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Fyco1Q8VDC1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fyco1Q8VDC1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fyco1Q8VDC1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fyco1Q8VDC1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fyco1Q8VDC1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Fyco1Q8VDC1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Fyco1Q8VDC1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Fyco1Q8VDC1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Fyco1Q8VDC1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Fyco1Q8VDC1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Fyco1Q8VDC1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Fyco1Q8VDC1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Fyco1Q8VDC1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fyco1Q8VDC1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fyco1Q8VDC1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fyco1Q8VDC1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Fyco1Q8VDC1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fyco1Q8VDC1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Fyco1Q8VDC1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Fyco1Q8VDC1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Fyco1Q8VDC1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Fyco1Q8VDC1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Fyco1Q8VDC1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Fyco1Q8VDC1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Fyco1Q8VDC1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Fyco1Q8VDC1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Fyco1Q8VDC1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Fyco1Q8VDC1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Fyco1Q8VDC1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Fyco1Q8VDC1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Fyco1Q8VDC1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Fyco1Q8VDC1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Fyco1Q8VDC1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Fyco1Q8VDC1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Fyco1Q8VDC1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Fyco1Q8VDC1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Fyco1Q8VDC1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Fyco1Q8VDC1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Fyco1Q8VDC1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Fyco1Q8VDC1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Fyco1Q8VDC1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Fyco1Q8VDC1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Fyco1Q8VDC1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Fyco1Q8VDC1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Fyco1Q8VDC1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Fyco1Q8VDC1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Fyco1Q8VDC1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Fyco1Q8VDC1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Fyco1Q8VDC1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Fyco1Q8VDC1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Fyco1Q8VDC1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Fyco1Q8VDC1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Fyco1Q8VDC1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Fyco1Q8VDC1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Fyco1Q8VDC1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Fyco1Q8VDC1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Fyco1Q8VDC1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Fyco1Q8VDC1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Fyco1Q8VDC1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Fyco1Q8VDC1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Fyco1Q8VDC1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Fyco1Q8VDC1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Fyco1Q8VDC1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Fyco1Q8VDC1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Fyco1Q8VDC1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Fyco1Q8VDC1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Fyco1Q8VDC1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Fyco1Q8VDC1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Fyco1Q8VDC1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Fyco1Q8VDC1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Fyco1Q8VDC1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Fyco1Q8VDC1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Fyco1Q8VDC1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms