Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sft2d2Q8VD57 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d2Q8VD57 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms