Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc9Q8VC31 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc9Q8VC31 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc9Q8VC31 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms