Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BbxQ8VBW5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
BbxQ8VBW5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms