Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup35Q8R4R6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup35Q8R4R6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms