Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0A6

Vstm2a, V-set and transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2aQ8R0A6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm2aQ8R0A6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm2aQ8R0A6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm2aQ8R0A6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm2aQ8R0A6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm2aQ8R0A6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm2aQ8R0A6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm2aQ8R0A6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm2aQ8R0A6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm2aQ8R0A6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vstm2aQ8R0A6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm2aQ8R0A6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.3 ms