Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Q3

Foxn4, Forkhead box protein N4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn4Q8K3Q3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Foxn4Q8K3Q3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxn4Q8K3Q3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxn4Q8K3Q3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms