Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
OptnQ8K3K8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
OptnQ8K3K8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms