Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cdk5rap2Q8K389 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdk5rap2Q8K389 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms