Protein–RNA interactions for Protein: Q8K363

Ddx18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx18Q8K363 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ddx18Q8K363 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Ddx18Q8K363 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx18Q8K363 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ddx18Q8K363 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx18Q8K363 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx18Q8K363 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx18Q8K363 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx18Q8K363 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx18Q8K363 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx18Q8K363 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddx18Q8K363 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddx18Q8K363 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddx18Q8K363 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddx18Q8K363 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddx18Q8K363 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddx18Q8K363 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms