Protein–RNA interactions for Protein: Q8K310

Matr3, Matrin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matr3Q8K310 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Matr3Q8K310 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Matr3Q8K310 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms