Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ncapd2Q8K2Z4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ncapd2Q8K2Z4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.5 ms