Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otud6bQ8K2H2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud6bQ8K2H2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud6bQ8K2H2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms