Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fcho1Q8K285 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fcho1Q8K285 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fcho1Q8K285 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fcho1Q8K285 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fcho1Q8K285 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fcho1Q8K285 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fcho1Q8K285 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fcho1Q8K285 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Fcho1Q8K285 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fcho1Q8K285 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fcho1Q8K285 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fcho1Q8K285 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fcho1Q8K285 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fcho1Q8K285 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fcho1Q8K285 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fcho1Q8K285 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Fcho1Q8K285 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fcho1Q8K285 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fcho1Q8K285 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fcho1Q8K285 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fcho1Q8K285 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fcho1Q8K285 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fcho1Q8K285 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fcho1Q8K285 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fcho1Q8K285 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fcho1Q8K285 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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