Protein–RNA interactions for Protein: Q8K221

Arfip2, Arfaptin-2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip2Q8K221 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfip2Q8K221 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfip2Q8K221 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms