Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nek9Q8K1R7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nek9Q8K1R7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nek9Q8K1R7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms