Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cldn34c1Q8K193 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c1Q8K193 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c1Q8K193 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c1Q8K193 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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Cldn34c1Q8K193 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c1Q8K193 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c1Q8K193 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c1Q8K193 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c1Q8K193 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c1Q8K193 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c1Q8K193 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c1Q8K193 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c1Q8K193 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c1Q8K193 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c1Q8K193 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c1Q8K193 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c1Q8K193 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Cldn34c1Q8K193 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Cldn34c1Q8K193 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Cldn34c1Q8K193 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c1Q8K193 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Cldn34c1Q8K193 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Cldn34c1Q8K193 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Cldn34c1Q8K193 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Cldn34c1Q8K193 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Cldn34c1Q8K193 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c1Q8K193 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms