Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne5Q8JZW4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne5Q8JZW4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms