Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syne4Q8CII8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Syne4Q8CII8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syne4Q8CII8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms