Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phc3Q8CHP6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phc3Q8CHP6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Phc3Q8CHP6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phc3Q8CHP6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms