Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHH9

Sept8, Septin-8, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept8Q8CHH9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sept8Q8CHH9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sept8Q8CHH9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sept8Q8CHH9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept8Q8CHH9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept8Q8CHH9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept8Q8CHH9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept8Q8CHH9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept8Q8CHH9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept8Q8CHH9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept8Q8CHH9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept8Q8CHH9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept8Q8CHH9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept8Q8CHH9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept8Q8CHH9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept8Q8CHH9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept8Q8CHH9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept8Q8CHH9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sept8Q8CHH9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sept8Q8CHH9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sept8Q8CHH9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sept8Q8CHH9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sept8Q8CHH9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept8Q8CHH9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept8Q8CHH9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept8Q8CHH9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept8Q8CHH9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept8Q8CHH9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept8Q8CHH9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept8Q8CHH9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept8Q8CHH9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sept8Q8CHH9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sept8Q8CHH9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sept8Q8CHH9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sept8Q8CHH9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sept8Q8CHH9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sept8Q8CHH9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sept8Q8CHH9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sept8Q8CHH9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sept8Q8CHH9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sept8Q8CHH9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sept8Q8CHH9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept8Q8CHH9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept8Q8CHH9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept8Q8CHH9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept8Q8CHH9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept8Q8CHH9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept8Q8CHH9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept8Q8CHH9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept8Q8CHH9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sept8Q8CHH9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms