Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Upp2Q8CGR7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms