Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm28Q8CGC6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Rbm28Q8CGC6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rbm28Q8CGC6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms