Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx8Q8CFD4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms