Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms