Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc17Q8CE13 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc17Q8CE13 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.3 ms