Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc38Q8CDN8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc38Q8CDN8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms