Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vcpip1Q8CDG3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vcpip1Q8CDG3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms