Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
6030452D12RikQ8CD33 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
6030452D12RikQ8CD33 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms