Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Phf20l1Q8CCJ9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms