Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phtf2Q8CB19 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phtf2Q8CB19 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms