Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8C5C9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q8C5C9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8C5C9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8C5C9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8C5C9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8C5C9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8C5C9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
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