Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1Y8

Ccz1, Vacuolar fusion protein CCZ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccz1Q8C1Y8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccz1Q8C1Y8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccz1Q8C1Y8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccz1Q8C1Y8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccz1Q8C1Y8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccz1Q8C1Y8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccz1Q8C1Y8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccz1Q8C1Y8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccz1Q8C1Y8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccz1Q8C1Y8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccz1Q8C1Y8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccz1Q8C1Y8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccz1Q8C1Y8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccz1Q8C1Y8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccz1Q8C1Y8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccz1Q8C1Y8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccz1Q8C1Y8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccz1Q8C1Y8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccz1Q8C1Y8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccz1Q8C1Y8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccz1Q8C1Y8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccz1Q8C1Y8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms