Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa22Q8C1N8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa22Q8C1N8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa22Q8C1N8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa22Q8C1N8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa22Q8C1N8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa22Q8C1N8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa22Q8C1N8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa22Q8C1N8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa22Q8C1N8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa22Q8C1N8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa22Q8C1N8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa22Q8C1N8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa22Q8C1N8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms