Protein–RNA interactions for Protein: Q8C084

Snx22, Sorting nexin 22, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx22Q8C084 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx22Q8C084 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms