Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Usp47Q8BY87 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Usp47Q8BY87 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Usp47Q8BY87 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Usp47Q8BY87 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Usp47Q8BY87 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Usp47Q8BY87 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Usp47Q8BY87 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Usp47Q8BY87 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Usp47Q8BY87 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Usp47Q8BY87 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Usp47Q8BY87 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Usp47Q8BY87 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Usp47Q8BY87 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Usp47Q8BY87 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Usp47Q8BY87 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Usp47Q8BY87 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Usp47Q8BY87 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Usp47Q8BY87 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Usp47Q8BY87 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Usp47Q8BY87 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Usp47Q8BY87 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Usp47Q8BY87 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Usp47Q8BY87 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Usp47Q8BY87 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Usp47Q8BY87 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Usp47Q8BY87 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Usp47Q8BY87 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Usp47Q8BY87 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Usp47Q8BY87 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Usp47Q8BY87 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Usp47Q8BY87 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp47Q8BY87 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp47Q8BY87 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms